就在王世充指挥着自己所在的战船趁着一片混战脱离战场之时，蒋元超和孙士汉之间的战斗也到了最后关头。
因为战船数量上的劣势，孙士汉一方已经是败势尽显，不仅有十几艘战船被击沉，死伤者更是不计其数。
蒋元超一方虽说伤亡也没好到哪里去，但惨胜也是胜，因此他内心还是大感痛快，甚至再次隔江嘲讽起了孙士汉来：
“孙士汉，别以为我不知道，你一直不服我，到处跟人说我水战本事不如你，不配做江南水师的将军。
今日我们真刀真枪干了一仗，结果又如何？事到如今，你还有什么好说的？”
面对蒋元超的嘲讽，孙士汉却兴致缺缺，甚至提不起一点反唇相讥的气力。
他看着江面上漂浮得到处都是的断裂木板，以及那些抱着木板大声呼救的士兵，再看着岸上同样渐渐失去悬念的战斗，面色一片灰暗，半个字也说不出来。
此时，蒋元超越发得意的声音又再次传入他的耳中：
“孙士汉，如果你还想保住自己一条狗命的话，现在就立即升起白旗投降，兴许本将军心情好了，还能大发善心饶你不死。”
短短几句话可谓是极尽羞辱，可孙士汉就像是什么都没听到一般，只是怔怔看着眼前的一切，眼底是无尽的绝望。
他知道自己已经败了，败得一塌糊涂。
他也知道以蒋元超和沈法兴的为人，自己一旦被生擒，会落得一个怎样的下场。
与其落在他们手中生不如死，倒不如自我了结来得干脆。
想到此处，他当即拔出腰间佩剑，在身旁所有人没有反应过来之时，一剑割断自己的咽喉，当场自刎身亡。
孙士汉一死，其他将士再无斗志，残余的战船接二连三升起了白旗投降。
至此，在付出二十几艘战船被击沉和上千名水兵伤亡的代价之后，江南水师还是平定了副将孙士汉的叛逃。
此时，岸上的战斗也以沈军大获全胜而告终，因为王世充及其一众子侄的临阵脱逃，导致王军士气迅速瓦解，不少士兵见势不妙，根本无心恋战，也纷纷跟着溜之大吉，剩下的人眼见逃不掉，便纷纷放下兵器向沈军投降。
此时天已经微微亮了，蒋元超眼见岸上的战斗也结束了，正想下令全部战船靠岸休整，自己要亲自去跟沈法兴报捷之时，一艘快船却鼓足风帆自西面而来，船上的人灰头土脸，隔着江面大老远就朝着船队的方向高呼道：
“蒋将军，大事不好了，水寨被烧了……”
“什么？水寨被烧了！”
听到江南水寨被烧，蒋元超只觉得眼前一黑，险些当场昏厥过去。
江南水师的其他将士同样是听得一清二楚，一个个也是一阵骇然。
没想到他们倾巢而出追击叛逃的战船，后方的水寨被人给偷袭了。
就在他们一个个还在思考到底是谁偷袭了江南水寨，北方的江面上却突然响起了隆隆的战鼓声，听得刚刚经历过一场大战的江南水师将士内心不由跟着一颤……
此时，岸上的沈法兴同样听到了江面上突如其来的战鼓声，面色陡然一片惨白。