崇祯十七年四月底，
安排好俘虏后，大军自锦州兵分两路，一路向西扫平各个建奴堡寨，
由吴三桂领兵，率领关宁铁骑和汉八旗的俘虏。
邵俊为其配备了一个连的榴弹炮营协助攻城，这些汉八旗的俘虏，在满清那边一直被不平等对待，
如今邵俊军饷奖赏给的足足的，这些人没有丝毫犹豫就选择了弃明投暗。
如今满清还没有入主中原，这些军队也还没有犯下滔天罪孽，邵俊决定给这些人一个机会。
另一路邵俊则亲率玄甲军与和三万五军营系统士卒以及朝廷的两万边军直扑沈阳城。
沿途多个城寨，多尔衮一直据城而守，邵俊只能用炮火攻城，
然炮弹有限，每一次用完都需要一个月的时间刷新，所以这次北伐打了一两年之久。
崇祯十七年六月，明军攻破义州、广宁，
使满清盛京沈阳城暴露在明军的铁蹄之下，建奴多尔衮只能让大军退守盛京。
崇祯十七年八月，明军相继攻下辽阳、抚顺两座军事重镇，将沈阳城三面包围。
崇祯十七年九月中旬，明军对沈阳发动总攻，
十月，大清盛京被攻陷，邵俊站在沈阳城的城头上，城墙已经面目全非，到处都是硝烟的味道，
沈阳城之战，满清八旗精锐尽失，多尔衮、多铎等数名旗主战死，
爱新觉罗·福临与一众满清皇室女眷被生擒送往京师。
从盛京突围出去的建奴不足万人，仓皇逃往建奴北方最后的据点赫图阿拉，此时的建奴已经成不了气候。